у меня постоянно возникал вопрос, почему, если я открываю thunar от root, не могу сохранить его параметры, как то вид, отображение скрытых папок. что бы я не делал, он постоянно открывался как новорожденный. так вот, автоматическое создание dbus X11 было отключено, поэтому у root thunar нет доступного действительного сеанса DBUS, в котором он хранит свои настройки.

задача имеет такое решение:

gksu dbus-run-session thunar

это можно прописать прямо в особые действия. тогда по пкм можно открыть выбранный каталог от рута и сохранить нужные параметры thunar.