После обновления Ардуино перестала определяться

Посмотри «ls /dev», Arduino видна как ttyUSB# (последняя цифра номер порта а-ля COM1, COM3 в windows). У меня вивод lsdev — Bus 001 Device 025: ID 1a86:7523 QinHeng Electronics HL-340 USB-Serial adapter, и arduino при том загружает прошивку, работает и виводит информацию в терминал. По поводу Arduino IDE, как по мне, не самий удобний вариант. Посмотри в сторону связки Platformio и VScode или Atom editor. Вот хорошая статья: alexgyver.ru/platformio-замена-arduino-ide/